Penyakit kista gigi cukup berbahaya, bahkan pengidap penyakit kista gigi seringkali tidak mengetahui atau menyadari bahwa ia mengidap penyakit kista gigi. Biasanya, penyakit ini baru diketahui saat dokter gigi melakukan pemeriksaan terhadap gigi yang terinfeksi atau saat melakukan perawatan terhadap saluran akar atau syaraf gigi.