Bunaken didirikan sebagai Taman Nasional di tahun 1991. Taman Nasional meliputi pulau Bunaken, Manado Tua, Mantehage, Siladen, Nain dan bagian dari Arakan Wowontulap, mencakup total area 89,065 ha. Bagi WWF, Taman Nasional Bunaken merupakan tempat utama bagi rencana kerja Sulu Sulawesi Marine Ecoregion. Apa saja keterlibatan WWF di Bunaken?
Memperbaiki manajemen perikanan melalui pengamatan cadangan ikan dan spesies indikator, dan perluasan dan pelaksanaan patroli dalam Taman Nasional Bunaken dan daerah perbatasannya.
Menguji penerapan pedoman manajemen efektif Kawasan Perlindungan Laut, dan menggunakan lesson learned untuk meningkatkan strategi konservasi untuk propinsi terbesar Sulawesi Utara. Ini termasuk integrasi rencana pembangunan tourisme, pengujian mekanisme keuangan untuk bagian Sulawesi Utara lainnya.