Pada umumnya hama yang menyerang tanaman jintan hitam adalah ulat, wereng dan serangga. Sementara itu, penyakitnya disebabkan cendawan patogen. Beberapa bahan - bahan pestisida nabati yang bisa digunakan untuk mengendalikan hama tersebut diantaranya campuran tembakau, mimba, lengkuas, serai, daun sambiloto, brotowali, bawang putih, dan biji srikaya yang dihancurkan. Jika salah satu bahan diantaranya tidak tersedia, bisa diabaikan.
Sumber : Buku Sembuhkan Penyakit dengan Habbatus Sauda yang disusun oleh Sufrida Yulianti dan Edi Junaedi